| Pendidikan berparadigma profetik: upaya konstruktif membongkar dikotomi sistem pendidikan Islam M Shofan Institute for Religion and Civil Society Development (Ircisod), 2004 | 197 | 2004 |
| Argumen Islam untuk pluralisme B Munawar-Rachman, M Shofan Gramedia Widiasarana Indonesia (Grasindo), 2010 | 69 | 2010 |
| Pluralisme Menyelamatkan agama-agama M Shofan Samudra Biru, 2011 | 62 | 2011 |
| Islam dan liberalisme BM Rachman, M Shofan Friedrich Naumann Stiftung, 2011 | 60 | 2011 |
| Jalan ketiga pemikiran Islam M Shofan IRCiSoD bekerjasama dengan Universitas Muhammadiyah Gresik, 2006 | 46 | 2006 |
| Argumen Islam untuk sekularisme BM Rakhman, M Shofan Gramedia Widiasarana Indonesia, 2010 | 35 | 2010 |
| Ekonomi Politik Pembangunan MD Rahardjo, FI Anshori, M Shofan (No Title), 2012 | 32 | 2012 |
| Menegakkan Pluralisme; Fundamentalisme-Konservatif di Tubuh Muhammadiyah M Shofan Yogyakarta: LSAF, 2008 | 30 | 2008 |
| Upaya Konstruktif Membongkar Dikotomi Sistem Pendidikan Islam M Shofan, PB Profetik Yogyakarta: IRCiSoD, 2004 | 24 | 2004 |
| The Realistic Education M Shofan Yogjakarta: Ircisod, 2007 | 22 | 2007 |
| Rhoma Irama, politik dakwah dalam nada M Shofan Penerbit Imania, 2014 | 18 | 2014 |
| Pendidikan karakter: pendidikan menghidupkan nilai untuk pesantren, madrasah, dan sekolah B Munawar-Rachman, M Shofan Paramadina, 2015 | 16 | 2015 |
| Agama, Sains, dan Covid-19: Mendialogkan Nalar Agama dan Sains Modern M Shofan, M Ag, DK Alka, SI Th, M Shofan, M Ag, KK Pribadi, M Si, ... Maarif 15 (1), 1-6, 2020 | 12 | 2020 |
| Menggugat Penafsiran Maskulinitas al-Qur’an: Menuju Kesetaraan Gender, dalam Jalan Ketiga Pemikiran Islam: Mencari Solusi Perdebatan Tradisionalisme dan Liberalisme M Shofan Yogyakarta: IRCiSoD, 2006 | 11 | 2006 |
| Mencari Solusi Perdebatan Tradisionalisme dan Liberalisme M Shofan, JKP Islam Jogjakarta: IRCiSoD, 2006 | 7 | 2006 |
| Mendiskursuskan Kembali Makna Moderatisme Muhammadiyah M Shofan | 5 | 2019 |
| keislaman yang Hanif N Madjid, B Munawar-Rachman, EP Taher, M Shofan Jakarta: Imania, 2013 | 5 | 2013 |
| Urgensi Pembacaan Ulang terhadap al-Qur’an: Menakar Kembali Kebenaran Agama M Shofan dalam Kembali ke al-Qur'an Menafsir Makna Zaman, ed. M. Hilmi Faiq (Malang …, 2004 | 5 | 2004 |
| Banyak Jalan Menuju Tuhan M Shofan, MT Hidayat Depok: Imania, 2013 | 4 | 2013 |
| Pemikiran Pendidikan Islam Menurut Al-Ghazali M Shofan TAZKIYAH 3 (1), 147-172, 2021 | 3 | 2021 |
